基本信息
姓名:劉智捷
出生年月:1984.12
性別:男
碩/博導(dǎo)：
民族:漢
開(kāi)設(shè)課程：普通遺傳學(xué)；普通遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)
職稱:講師
研究方向：玉米抗逆分子生物學(xué)
學(xué)位:理學(xué)博士

聯(lián)系方式辦公電話：18207192678
電子郵件：zhijie5.liu@gmail.com

個(gè)人簡(jiǎn)介1.碩士期間參與了“逆境條件下玉米苗期根系miRNA的表達(dá)與調(diào)控機(jī)理研究”，利用小RNA芯片技術(shù)鑒定高鹽脅迫和低氧脅迫下誘導(dǎo)表達(dá)的miRNA，從中建立了miRNA與淹水、高鹽逆境的關(guān)系，并進(jìn)一步對(duì)miRNA參與的逆境響應(yīng)通路進(jìn)行了推測(cè)和分析。相關(guān)研究成果分別在2008年[5]和2009年[6]均發(fā)表于AnnalsofBotany雜志上。
2.2008年以碩博連讀的培養(yǎng)方式轉(zhuǎn)入到博士期間的學(xué)習(xí)，并經(jīng)鄭用璉教授推薦到美國(guó)冷泉港DoreenWare教授實(shí)驗(yàn)室交流學(xué)習(xí)三年，期間主要進(jìn)一步深入探討miRNA對(duì)漬水逆境的響應(yīng)及其調(diào)控途徑。通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)miRNA的表達(dá)量進(jìn)行了深入的定量分析；利用qPCR對(duì)miRNA以及其下游靶基因的表達(dá)進(jìn)行了進(jìn)一步的確認(rèn)；分析了miRNA基因啟動(dòng)子區(qū)的順式作用元件，構(gòu)建了miRNA介導(dǎo)的、玉米根系細(xì)胞響應(yīng)短期漬害脅迫的基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，闡述了miRNA在短期漬害逆境條件下參與的代謝及信號(hào)通路，并提出了miRNA介導(dǎo)的玉米根系細(xì)胞響應(yīng)漬害的“節(jié)能假說(shuō)”。相關(guān)研究成果以第一作者發(fā)表在PLoSOne雜志上[4]。
3.在冷泉港的三年期間，也參與了其他課題的研究工作：
1）參與了玉米基因組測(cè)序計(jì)劃，構(gòu)建了部分測(cè)序文庫(kù)，為玉米B73全基因組測(cè)序提供了實(shí)驗(yàn)材料和分析數(shù)據(jù)。相關(guān)工作于2009年作為封頁(yè)文章發(fā)表于Science雜志上[1]。
2）構(gòu)建了5個(gè)玉米不同組織的小RNA文庫(kù)，用于高通量測(cè)序。學(xué)習(xí)并參與了后期的數(shù)據(jù)分析。研究結(jié)果于2009年發(fā)表于PLoSGenetics雜志上[3]。
3）參與了擬南芥轉(zhuǎn)錄因子文庫(kù)的構(gòu)建工作中，共構(gòu)建了由712轉(zhuǎn)錄因子所構(gòu)成的轉(zhuǎn)錄因子文庫(kù)。利用這一文庫(kù)篩選了玉米以及擬南芥miRNA的啟動(dòng)子，構(gòu)建了miRNA的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。部分結(jié)果于2011年發(fā)表于NatureMethod雜志上[2]。
4.開(kāi)展了玉米冠根中miRNA對(duì)長(zhǎng)期淹水逆境脅迫響應(yīng)的機(jī)理研究，參與了數(shù)據(jù)分析及論文的撰寫、修改。研究結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了所提出的miRNA介導(dǎo)的漬害響應(yīng)“節(jié)能假說(shuō)”，并以并列第一作者身份于2012年發(fā)表于PhysiologiaPlantarum雜志上[7]。

科研項(xiàng)目

發(fā)明專利及獲獎(jiǎng)情況

發(fā)表的論文及著作第一作者發(fā)表：
1.LiuZ,KumariS,ZhangL,ZhengY*,WareD*.CharacterizationofmiRNAsinresponsetoshort-termwaterlogginginthreeinbredlinesofZeamays.PLoSOne,2012;7(6):e39786.Epub2012Jun29.
2.ZhaiL,LiuZ,ZouX,JiangY,QiuF,ZhengY,ZhangZ*:Genome-wideIdentificationandAnalysisofMicroRNARespondingtoLong-TermwaterlogginginCrownRootsofMaizeSeedlings.PhysiologiaPlantarum,2012.doi:10.1111/j.1399-3054.2012.01653.x.（并列第一作者）

合作作者發(fā)表：
1.SchnablePS,WareD,FultonRS,SteinJC,WeiF,PasternakS,LiangC,ZhangJ,FultonL,GravesTA,MinxP,ReilyAD,CourtneyL,KruchowskiSS,TomlinsonC,StrongC,DelehauntyK,FronickC,CourtneyB,RockSM,BelterE,DuF,KimK,AbbottRM,CottonM,LevyA,MarchettoP,OchoaK,JacksonSM,GillamB,ChenW,YanL,HigginbothamJ,CardenasM,WaligorskiJ,ApplebaumE,PhelpsL,FalconeJ,KanchiK,ThaneT,ScimoneA,ThaneN,HenkeJ,WangT,RuppertJ,ShahN,RotterK,HodgesJ,IngenthronE,CordesM,KohlbergS,SgroJ,DelgadoB,MeadK,ChinwallaA,LeonardS,CrouseK,ColluraK,KudrnaD,CurrieJ,HeR,AngelovaA,RajasekarS,MuellerT,LomeliR,ScaraG,KoA,DelaneyK,WissotskiM,LopezG,CamposD,BraidottiM,AshleyE,GolserW,KimH,LeeS,LinJ,DujmicZ,KimW,TalagJ,ZuccoloA,FanC,SebastianA,KramerM,SpiegelL,NascimentoL,ZutavernT,MillerB,AmbroiseC,MullerS,SpoonerW,NarechaniaA,RenL,WeiS,KumariS,FagaB,LevyMJ,McMahanL,VanBurenP,VaughnMW,YingK,YehCT,EmrichSJ,JiaY,KalyanaramanA,HsiaAP,BarbazukWB,BaucomRS,BrutnellTP,CarpitaNC,ChaparroC,ChiaJM,DeragonJM,EstillJC,FuY,JeddelohJA,HanY,LeeH,LiP,LischDR,LiuS,LiuZ,NagelDH,McCannMC,SanMiguelP,MyersAM,NettletonD,NguyenJ,PenningBW,PonnalaL,SchneiderKL,SchwartzDC,SharmaA,SoderlundC,SpringerNM,SunQ,WangH,WatermanM,WestermanR,WolfgruberTK,YangL,YuY,ZhangL,ZhouS,ZhuQ,BennetzenJL,DaweRK,JiangJ,JiangN,PrestingGG,WesslerSR,AluruS,MartienssenRA,CliftonSW,McCombieWR,WingRA,WilsonRK*:TheB73maizegenome:complexity,diversity,anddynamics.Science326(5956):1112-1115,2009.
2.GaudinierA,ZhangL,Reece-HoyesJS,Taylor-TeeplesM,PuL,LiuZ,BretonG,Pruneda-PazJL,KimD,KaySA,WalhoutAJM,WareD,BradySM.EnhancedY1HassaysforArabidopsis.Naturemethods,2011.8:1053-1055.
3.ZhangL,ChiaJM,KumariS,SteinJC,LiuZ,NarechaniaA,MaherCA,GuillK,McMullenMD,WareD*:Agenome-widecharacterizationofmicroRNAgenesinmaize.PLoSGenet5(11):e1000716,2009.
4.ZhangZ,WeiL,ZouX,TaoY,LiuZ,ZhengY*:Submergence-responsiveMicroRNAsarepotentiallyinvolvedintheregulationofmorphologicalandmetabolicadaptationsinmaizerootcells.AnnBot102(4):509-519,2008.被引用次數(shù)：37.IF(2008):3.501
5.DingD,ZhangL,WangH,LiuZ,ZhangZ,ZhengY*:DifferentialexpressionofmiRNAsinresponsetosaltstressinmaizeroots.AnnBot103(1):29-38,2009.