中國科學院光電研究院（以下簡稱光電院）建于2003年11月，作為中國科學院“知識創(chuàng)新工程”中體制機制創(chuàng)新的重大改革舉措之一，是兼具總體管理與總體技術職能的高技術研究單位；同年，中國科學院空間科學與應用總體部作為組織實施中科院承擔的載人航天工程重大專項任務的非法人研究單位，依托光電院。2009年3月，中國科學院成立二代導航專項總體部，依托光電院，構成了光電院在光電與空間領域的總體構架。

光電院的主要學科領域是光電工程領域以及與光電信息獲取、傳輸、處理和應用相關的航空科技領域、航天科技領域和應用科技領域，重點開展新型光電探測、測量系統(tǒng)總體設計及其標準化技術研究，新型激光技術應用系統(tǒng)總體設計集成研究，空間應用系統(tǒng)總體設計集成技術研究，空間有效載荷支持系統(tǒng)關鍵技術研究，對地觀測信息與導航處理與應用系統(tǒng)技術研究，高空科學氣球、系留氣球工程和平流層飛艇（臨近空間飛行器）系統(tǒng)集成及其關鍵技術研究。

光電院建立了系統(tǒng)總體的組織機構與管理體制，主要科研單元有空間系統(tǒng)工程研究部、光電系統(tǒng)工程研究部、有效載荷應用中心、對地觀測技術應用研究部以及與高能物理研究所聯(lián)合組建的“氣球飛行器研究中心”。組建了可靠性保障中心、空間軟件評測站作為科研支撐部門。

同時，為拓展科研領域，加強院地合作，光電院與國家減災中心聯(lián)合組建了“中國空間技術減災應用研究中心”，與西安電子科技大學、國科環(huán)宇公司聯(lián)合成立“數(shù)據(jù)壓縮聯(lián)合實驗室”；與青島市政府共建“光電院青島研發(fā)基地”。

截止2009年底，光電研究院共有在職職工309人。其中，科研人員223人，科技支撐人員37人，包括中國科學院院士1人，正高級專業(yè)技術人員37人、副高級專業(yè)技術人員90人，“百人計劃”2人；客座研究員4人。員工平均年齡34.6歲。光電院共有6個碩士研究生培養(yǎng)點和2個博士研究生培養(yǎng)點，2009年共有在學研究生139人，其中博士生30人、碩士生107人，在站博士后2人。

由光電院牽頭組織建設的中科院北京新技術基地占地190畝，建筑面積18萬平方米（包括地上、地下），其中光電院為3.78萬平方米。2010年10月，光電院將搬入新園區(qū)工作。

中國科學院空間科學與應用總體部

中國科學院空間科學與應用總體部（以下簡稱空間總體部）成立于1993年，是受中國科學院委托，代表中國科學院對有關空間科學與應用任務實施工程管理、總體技術集成和運行管理；建立質(zhì)量標準體系和必要的技術保障條件，為全院有關工作提供技術支撐服務的總體機構。

由空間總體部負責具體組織管理、承擔系統(tǒng)設計、集成的載人航天工程空間應用系統(tǒng)，是我國載人航天工程八大系統(tǒng)之一，是我國空間活動任務中規(guī)模最大、涉及領域最廣的空間科學與應用研究任務。經(jīng)過長達十六年的艱苦奮斗，取得了七艘飛船全部應用任務的圓滿成功，在空間光電有效載荷及對地觀測，空間科學實驗和探測等方面，取得了一批具有重大價值的科學與應用成果，建成了具有先進水平的技術支持平臺和工程管理體系，在我國的空間科學與應用領域，取得了跨越性突破。根據(jù)中國科學院的決定，空間總體部劃歸光電研究院，繼續(xù)負責國家載人航天計劃空間應用系統(tǒng)的總體工作和后續(xù)工程，并開拓空間科學與應用的新領域，更好地發(fā)揮中國科學院作為我國空間科技戰(zhàn)略方面軍的作用。