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男,湖南衡陽人,1968年7月生。1991年7月畢業(yè)于同濟大學化學系,獲理學學士學位;1996年7月畢業(yè)于中國科學院上海藥物研究所,獲理學博士學位。1996年10月至2000年3月在瑞典卡羅林醫(yī)學院(KarolinskaInstitute)進行博士后研究,2000年3月至2002年2月在美國國家衛(wèi)生研究院(NIH)癌癥研究所(NCI)進行訪問研究,2002年3月起進入加拿大的生物制藥公司工作,先后在GlycoDesignInc.和MDSProteomicsInc.任職研究員。2004年5月回國,任復旦大學藥學院教授。2004年9月起應邀進入華東理工大學工作,參與藥學院創(chuàng)建及學科建設。2005年入選上海市首批“浦江人才計劃”,2008年入選教育部“新世紀優(yōu)秀人才支持計劃”。2006-2015年曾任藥學院副院長,現(xiàn)任藥學院教授、博士生導師。主要學術(shù)兼職有:上海市學位委員會學科評議組成員(藥學學科),中國化學會計算機化學專業(yè)委員會委員,上海市藥學會藥物化學專業(yè)委員會委員,上海市新藥設計重點實驗室學術(shù)委員會委員,《華東理工大學學報(自然科學版)》編輯委員會委員,中國毒理學會會員、美國化學會會員,J.Chem.Inf.Model.EditorialAdvisoryBoardMember(Jan.2016-Dec.2017)。
研究專長為計算機輔助藥物設計、化學信息學、計算毒理學、計算生物學等,目前承擔著國家自然科學基金等科研項目,已在J.Med.Chem.,BriefingsinBioinformatics,PLoSComput.Biol.,J.Chem.Inf.Model.,Mol.BioSystems等國內(nèi)外專業(yè)期刊發(fā)表SCI論文120余篇,申請中國發(fā)明專利9項(其中授權(quán)3項,公開6項),獲得計算機軟件著作權(quán)2項。
主講本科生課程《藥物設計學》、《藥物化學II》,碩士生課程《計算機輔助藥物設計》、《藥學導論》,博士生課程《創(chuàng)新藥物研究進展》(前沿講座)、《專業(yè)文獻綜述與講座》等。主編本科教材《藥學專業(yè)實驗教程》(十一五國家重點圖書,普通高等教育制藥類專業(yè)規(guī)劃教材,華東理工大學出版社,2010年7月出版),主譯學術(shù)專著《藥物分子設計-從入門到精通》(當代化學譯叢,華東理工大學出版社,2012年3月出版);參編“十一五”國家級規(guī)劃教材、復旦大學葉德泳教授主編的《藥物設計學》(第三版,高等教育出版社,2015年8月出版);參譯學術(shù)專著《實用藥物化學》(ThePracticeofMedicinalChemistry,3rdEdition.科學出版社,2012年4月出版)。已指導本科畢業(yè)生32名,碩士畢業(yè)生19名,博士畢業(yè)生7名,博士后出站4名。
曾獲得1997年中國科學院自然科學二等獎(第六完成人)。2007年1月獲得“天鼎-東岳”研究生獎教金一等獎;2008年5月獲得華東理工大學育英獎;2008年8月獲得華東理工大學教育教學成果三等獎(第一完成人);2009年9月獲得上海市育才獎;2010年10月,經(jīng)全校研究生投票推選,獲得華東理工大學第二屆“我心目中的良師益友”獎;2010年11月獲得寶鋼優(yōu)秀教師獎;2011年1月獲得校優(yōu)秀研究生指導教師稱號;2013年1月獲得校優(yōu)秀研究生指導教師稱號;2013年1月作為第一完成人獲得校教育教學成果獎一等獎、二等獎各一項;2014年1月獲得上海市教學成果一等獎(第四完成人);2015年6月再次獲得校優(yōu)秀研究生指導教師稱號。
主要研究方向
(1)計算機輔助藥物設計:這是目前國際上十分活躍的研究領(lǐng)域,它以計算機為工具,充分利用已知的生物大分子靶標和/或藥物分子結(jié)構(gòu)活性知識,通過分子模擬、虛擬篩選、理論計算和預測等現(xiàn)代計算化學技術(shù),來指導和輔助新型藥物分子的發(fā)現(xiàn)和設計。目前已有許多計算機輔助設計的成功例證,并在創(chuàng)新藥物研究中顯示了強大的優(yōu)勢,大大加快了藥物發(fā)現(xiàn)的進程。實驗室目前與學院內(nèi)外多個教授合作,綜合利用虛擬篩選、三維定量構(gòu)效關(guān)系分析、藥效團模建以及虛擬組合庫設計等多種藥物設計手段,主要針對腫瘤、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、代謝性疾病、感染性疾病等靶標進行先導化合物發(fā)現(xiàn)、設計和優(yōu)化研究。
(2)藥物信息學和計算毒理學:一方面,主要基于系統(tǒng)生物學和化學基因組學等技術(shù),開發(fā)網(wǎng)絡藥理學研究新方法,如基于網(wǎng)絡的推理算法預測藥物-靶標相互作用網(wǎng)絡,可用于新藥和新靶標發(fā)現(xiàn),也用于老藥新用研究;另一方面,主要采用化學信息學技術(shù),比如子結(jié)構(gòu)模式識別、信息增益、組合分類器等,對藥物代謝動力學性質(zhì)及藥物安全性等進行預測研究;同時,利用所開發(fā)的方法和技術(shù),進行化合物的生態(tài)環(huán)境風險評估、計算環(huán)境毒理學等研究。
(3)計算生物學:生物大分子之間的相互作用,如蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-核酸、蛋白質(zhì)-多糖之間的相互作用是生命活動的基礎,同時也是藥物設計研究的基礎。這些相互作用不是靜止不變的而是動態(tài)變化的,但目前的實驗條件除了測定相互作用體的復合物之外,還難以在分子水平上研究這些動態(tài)相互作用的各個方面。而計算機模擬研究則可在虛擬現(xiàn)實的情況下,基于實驗測定的復合物結(jié)構(gòu),在分子水平上對這些相互作用從動力學和熱力學角度進行定性和定量的分析研究,是對實驗研究的重要補充和完善。實驗室目前主要采用分子動力學模擬和結(jié)合自由能計算方法對蛋白-蛋白、蛋白-核酸、蛋白-小分子等相互作用體系進行深入研究,闡明其相互作用機理,進而開發(fā)可以調(diào)節(jié)其生理功能的活性小分子。
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